为确定两个或多个序列之间的相似性以至于同源性,而将它们按照一定的规律排列。将两个或多个序列排列在一起,标明其相似之处。序列中可以插入间隔(通常用短横线“-”表示)。对应的相同或相似的符号(在核酸中是A, T(或U), C, G,在蛋白质中是氨基酸残基的单字母表示)排列在同一列上。这一方法常用于研究由共同祖先进化而来的序列,特别是如蛋白质序列或DNA序列等生物序列。在比对中,错配与突变相应,而空位与插入或缺失对应。序列比对还可用于语言进化或文本间相似性之类的研究。术语“序列比对”也指构建上述比对或在潜在的不相关序列的数据库中寻找significant alignments。
【序的意思】:序 xù(ㄒㄨˋ) (一)、次第:顺序。秩序。次序。工序。程序。序数。(二)、排列次第:序次。序列。 详情>
【列的意思】:列 liè(ㄌ一ㄝˋ) (一)、排成的行:罗列。行( háng )列。队列。列岛。(二)、众多,各: 详情>
【比的意思】:比 bǐ(ㄅ一ˇ) (一)、较量高低、长短、远近、好坏等:比赛。比附。对比。评比。(二)、能够相匹: 详情>
【对的意思】:对(對) duì(ㄉㄨㄟˋ) (一)、答,答话,回答:对答如流。无言以对。(二)、朝着:对酒当歌。( 详情>
• 一种基于序列比对的路由对称性定量分析方法
• 局部多序列比对可以用来刻画蛋白质家族和超家族。
• 通过合理的编码表示,采用相应的遗传算子,设计了一种求生物序列比对的遗传算法。
• 序列比对分析是生物信息学研究中的一个基本内容。大多数序列比对软件以动态规划算法作为其空位插入的核心算法。